ارتقاء اعضاء هیأت علمی یکی از برنامه‌ های دانشگاه است که بر اساس ارزیابی فعالیت‌ های چهارگانه فرهنگی- تربیتی و اجتماعی، آموزشی، پژوهشی- فناوری و علمی- اجرایی محقق می‌ گردد. این امر نه تنها سبب ارتقاء رتبه آموزشی عضو هیأت علمی می‌ گردد بلکه باعث اعتلا و ارتقاء محیط آموزشی و پژوهشی در دانشگاه نیز می‌ شود. به همین منظور هیأت ممیزه در هر یک از دانشگاههای واجد شرایط تشکیل گردیده است.

هیأت ممیزه دانشگاه شهید باهنر کرمان نیز در همین راستا و به منظور اجرای فرایند ارتقا مرتبه اعضای هیأت علمی فعالیت خود را در شهریور ماه ۱۳۷۸ به همت آقای دکتر علی مصطفوی رئیس وقت دانشگاه از طریق أخذ مجوزهای لازم از وزارت عتف آغاز نمود و پس از مدت کوتاهی امور مربوط به هیأت ممیزه دانشگاه‌ های منطقه جنوب شرق را نیز تحت پوشش فعالیت‌ های خود قرار داد و با عنوان « هیأت ممیزه دانشگاه‌ های منطقه جنوب شرق» ادامه یافت.

  با فعال شدن هیأت ممیزه در دانشگاه شهید با هنر و ایجاد انگیزه و رقابت نزدیک و سازندة فعالیت‌ های علمی و پژوهشی بین اعضای هیأت علمی کوشا و توانای دانشگاه‌ های منطقه، دانشگاه‌ های سیستان و بلوچستان، یزد، زابل، ولی عصر (عج)، هرمزگان، تحصیلات تکمیلی صنعتی و فنّاوری پیشرفته ماهان از نظر تعداد دانشیار و استاد برای تأسیس هیأت ممیزه مستقل به حد نصاب رسیدند و هم اکنون دارای هیأت ممیزه مستقل هستند.

این هیأت فعالیت خود را به ریاست آقایان دکتر احمد امیری خراسانی، دکترنصرالله گرامی، دکتر محمّدجواد فدایی فتح آبادی و دکتر محمّد علی طاهر و دکتر حسین اکبری فرد، آمار بسیار مطلوبی در ارتقا اعضای هیأت علمی منطقه جنوب شرق و استان کرمان در کارنامه دارد. هیأت ممیزه دانشگاه شهید باهنر کرمان هم اکنون دانشگاه‌ های جیرفت و صنعتی سیرجان و مجتمع آموزش عالی بم را تحت پوشش دارد.

هیأت ممیزه دانشگاه در حال حاضر دارای چهارده کمیسیون تخصصی به شرح زیر می‌ باشد.